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PerlPrimerというprimer設計ソフト トピック削除
No.1185-TOPIC - 2008/05/22 (木) 20:45:40 - PerlPrimer
PerlPrimerというプライマー設計ソフトをwebで見つけたのですが、上手く動作しません。

http://perlprimer.sourceforge.net/

具体的には、パソコン内にあるファイル(.txtもしくは.fasta)を開こうとするとCould not openというエラー表示が出てファイルを開くことができません。

Ensembleというサイトからgenomeデータを取ってくることはできるのですが、EnsembleにないmRNAのデータを取り扱いたくて困っています。

どのようにすれば、ファイルを開くことができるのでしょうか。


使用しているOSは、WindowsXPです。

このソフト以外のソフトやサイトを利用する代替案はなしでお願いします。
 
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path名で解決できました。 解決済み 削除/引用
No.1185-4 - 2008/05/23 (金) 10:09:20 - PerlPrimer
mさん、scriptさんありがとうございます。

scriptさんの言われたとおり、pathから日本語を除くとファイルを開くことができました。

(無題) 削除/引用
No.1185-3 - 2008/05/22 (木) 23:38:46 - Script
ひょっとしたらですが、

日本語のPath名が通らないのかもしれません。Script言語で書かれた外国製のアプリにはありがちです。
ファイル名、フォルダ名は半角英数にする、デスクトップ(実際にはデスクトップという日本語名のフォルダ)には置かずに、
ボリュームの第一階層に置くか、ユーザーフォルダに置くなど試してみては。

(無題) 削除/引用
No.1185-2 - 2008/05/22 (木) 21:33:50 - m
なぜこれにこだわられるかはわかりませんが、
DNA sequenceを貼り付けたらいいと思いますが・・・。
modified fastaは読み込めると書いてありました。

PerlPrimerというprimer設計ソフト 削除/引用
No.1185-1 - 2008/05/22 (木) 20:45:40 - PerlPrimer
PerlPrimerというプライマー設計ソフトをwebで見つけたのですが、上手く動作しません。

http://perlprimer.sourceforge.net/

具体的には、パソコン内にあるファイル(.txtもしくは.fasta)を開こうとするとCould not openというエラー表示が出てファイルを開くことができません。

Ensembleというサイトからgenomeデータを取ってくることはできるのですが、EnsembleにないmRNAのデータを取り扱いたくて困っています。

どのようにすれば、ファイルを開くことができるのでしょうか。


使用しているOSは、WindowsXPです。

このソフト以外のソフトやサイトを利用する代替案はなしでお願いします。

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