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レポータージーンアッセイのベクター トピック削除
No.1179-TOPIC - 2008/05/21 (水) 19:22:43 - T
長文ですがよろしくお願いします。

最近、レポータージーンアッセイを始めました。
アッセイ系としては、
・pcDNA+目的転写因子
・pGL3+目的プロモーター
・pRL-TK
を一緒にトランスフェクションして、目的転写因子の発現が目的プロモーターにどう影響するか調べています。

トランスフェクション効率を見るために、pRL-TKのRenilla luciferaseの発現を見ているのですが、ある目的転写因子(A)の発現のときだけ、他に比べてRenilla luciferaseの発現が大幅に減少します(1/20くらいに)。すべてのプラスミドを精製しなおしやり直したのですが、同じでした。
可能性としてその目的転写因子(A)がpRL-TKのプロモーターに影響していることが考えられます。そこで、pRL-TKを別のプラスミドに変更しようと思っているます。プロメガの他のベクターpRL-CMV、pRL-SV40も考えているのですが、値段が高い気がします。

どなたか安くて良いベクターご存じないでしょうか?

出来ればRenilla luciferaseベクターがいいのですが、b-galとかでもOKです。その場合、使用しているキットの組み合わせ(Luc用とb-gal用)も教えていただければ幸いです。

何か情報がありましたら教えていただきたいと思います。
 
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(無題) 削除/引用
No.1179-8 - 2008/05/23 (金) 00:59:46 - おお
>[Re:6] Tさんは書きました :
> もうひとつ質問が。。。
>
> もしかするとb-gal発現のベクターがインターナルコントロールベクター候補として使用できるかも出来ないのですが、その場合どうやってfirefly luciferaseとb-galを同じサンプルで検出しようか考えています。
>
> 現在、プロメガのDual-Luciferase Reporter Assay Systemを使用しているのですが、これに付属のlysis bufferで調整したサンプルを用いてb-galアッセイできるキットをご存知の方おられませんでしょうか?
>
> お教えいただければ幸いです。

http://www.promega.com/catalog/catalogproducts.aspx?categoryname=productleaf_295
プロメガのキットです。
β-Galactosidase Enzyme Assay System with Reporter Lysis Buffer
最近はこの手の実験をしないのでプロメガがどんなLYSIS BUFFERを使っているかとか情報にうといので、てもとのプロダクトマニュアルやホームページFAQなど一度見られると良いと思います。

(無題) 削除/引用
No.1179-7 - 2008/05/23 (金) 00:46:34 - おお

>
> 一つ一つプロモーターを試すしかないのしょうね。
> お金と時間の許す限り、試したいと思います。

レポーター遺伝子(あなたのためしたいpGLのプロモータールシフェラーゼコンストラクト)を細胞にステイブルに導入して、その細胞で比較すると、トランスフェクションのインターナルコントロールを取らなくても比較ができますよ。

(無題) 削除/引用
No.1179-6 - 2008/05/22 (木) 17:20:00 - T
もうひとつ質問が。。。

もしかするとb-gal発現のベクターがインターナルコントロールベクター候補として使用できるかも出来ないのですが、その場合どうやってfirefly luciferaseとb-galを同じサンプルで検出しようか考えています。

現在、プロメガのDual-Luciferase Reporter Assay Systemを使用しているのですが、これに付属のlysis bufferで調整したサンプルを用いてb-galアッセイできるキットをご存知の方おられませんでしょうか?

お教えいただければ幸いです。

(無題) 削除/引用
No.1179-5 - 2008/05/22 (木) 17:13:36 - T
皆様、貴重な情報ありがとうございます。

^様、
>>ある目的転写因子とpGL3の組み合わせで、大量のFirefly luciferaseが発現するために、そちらに材料が喰われてRenillaの発現が落ちているというわけではないのですよね。

今回の場合はそうではないようです。というのも、ポジコンとして用いた転写因子はさらに大量のFirefly luciferaseが発現してもRenillaの発現は安定していましたので。


ほとんどやられていない転写因子なので、プロモーターアッセイの論文が少なく、また、プロモーターアッセイしている論文でもタンパク質量をインターナルコントロールにしているものでした。

一つ一つプロモーターを試すしかないのしょうね。
お金と時間の許す限り、試したいと思います。

(無題) 削除/引用
No.1179-4 - 2008/05/22 (木) 12:36:03 - おお
私は大昔ですがpCH101をつかってました。LacZがSV40で発現するようになっています。今どこで扱っているかとは分からないのですが、、、、TKでと言う事なのでSV40に変えるのもてかなと思いますし。ただ、これpBR系のプラスミド何ですよね。大腸菌あたりのコピーナンバーが少ないので精製の収量は落ちると思います。

pGL2を使っていて、pGL3が出た時ぐらいの話です。実際にpCH101を使ってルシフェラーゼあっせいのインターナルコントロールを取っている論文は可也そのころあったと思います。

(無題) 削除/引用
No.1179-3 - 2008/05/22 (木) 11:56:12 - ats
使ったことが無いけど、pGL4.74[hRluc/TK]は転写因子結合サイトが減らしてあるそうです。
http://www.promega.co.jp/Cre_Html.php?pGMPID=1010011

(無題) 削除/引用
No.1179-2 - 2008/05/22 (木) 11:45:46 - ~
pGL3を入れていない、pRL-TK+pcDNA-目的転写因子と、pRL-TK+pcDNA(ヌル)で比較しても、Renillaの発現が落ちるのですよね。

ある目的転写因子とpGL3の組み合わせで、
大量のFirefly luciferaseが発現するために、
そちらに材料が喰われてRenillaの発現が落ちているというわけではないのですよね。

>どなたか安くて良いベクターご存じないでしょうか?
この場合のいいベクターかどうかは、目的を満たすかどうかですので、
書かれていない転写因子に反応しないプロモーターのお薦めは出てこないと思いますが…

目的の転写因子でのプロモーターアッセイの論文がなく、
使えるコントロールのプロモーターは分からないのですよね。
そうであれば、1個の次のプロモーターを買って試してみても使えるか分かりませんので、
使えるプロモーターをスクリーニングしたほうがいいと思います。

pRL-basic に手持ちのプロモーターをいろいろと入れてみて、
目的の転写因子が影響しないものをスクリーニングしてはいかがでしょうか。

安くというのであれば、pRL-TKのプロモーター部分を除けば、
ベクターは買わなくて済みます。

レポータージーンアッセイのベクター 削除/引用
No.1179-1 - 2008/05/21 (水) 19:22:43 - T
長文ですがよろしくお願いします。

最近、レポータージーンアッセイを始めました。
アッセイ系としては、
・pcDNA+目的転写因子
・pGL3+目的プロモーター
・pRL-TK
を一緒にトランスフェクションして、目的転写因子の発現が目的プロモーターにどう影響するか調べています。

トランスフェクション効率を見るために、pRL-TKのRenilla luciferaseの発現を見ているのですが、ある目的転写因子(A)の発現のときだけ、他に比べてRenilla luciferaseの発現が大幅に減少します(1/20くらいに)。すべてのプラスミドを精製しなおしやり直したのですが、同じでした。
可能性としてその目的転写因子(A)がpRL-TKのプロモーターに影響していることが考えられます。そこで、pRL-TKを別のプラスミドに変更しようと思っているます。プロメガの他のベクターpRL-CMV、pRL-SV40も考えているのですが、値段が高い気がします。

どなたか安くて良いベクターご存じないでしょうか?

出来ればRenilla luciferaseベクターがいいのですが、b-galとかでもOKです。その場合、使用しているキットの組み合わせ(Luc用とb-gal用)も教えていただければ幸いです。

何か情報がありましたら教えていただきたいと思います。

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