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coiled-coil window 14, 21, 28
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No.1136-TOPIC - 2008/05/15 (木) 15:11:20 - コイル
COILS(
http://www.ch.embnet.org/software/COILS_form.html
)などでアミノ酸配列いれるとwindow14, 21, 28って出るのですが、この意味をどなたかご教授願えませんでしょうか?? heptad repeatの撮り方が違うのはわかるのですが、どういうふうにしているのかさっぱりです・・・orz
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No.1136-3 - 2008/05/15 (木) 20:09:08 - コイル
ありがとうございます!
教えていただいたHPを読ませていただきます!!
(無題)
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No.1136-2 - 2008/05/15 (木) 19:12:34 -
おお
http://www.ch.embnet.org/software/coils/COILS_doc.html
並んでいる14残基をとりだして計算してスコアーをだすのがwindow14
と言う事だろうと思います。示しましたホームページアドレスに
たいてい21のときがクリアーな結果を与えると書いています。
ざっと眺めただけなので、一度お読みになるといいかとおもいます。
元文献も情報として参考になると思いますので、読んでみればどうですか?
coiled-coil window 14, 21, 28
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No.1136-1 - 2008/05/15 (木) 15:11:20 - コイル
COILS(
http://www.ch.embnet.org/software/COILS_form.html
)などでアミノ酸配列いれるとwindow14, 21, 28って出るのですが、この意味をどなたかご教授願えませんでしょうか?? heptad repeatの撮り方が違うのはわかるのですが、どういうふうにしているのかさっぱりです・・・orz
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