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DNaseI Footprinting トピック削除
No.1133-TOPIC - 2008/05/15 (木) 11:17:21 - rei
現在、DNaseI Footprintingにて転写因子の結合サイトの同定を試みています。
様々なプロトコルに「DNA片鎖の末端をラベルして解析に用いる」と書いてあります。

今回私は、アンチセンス鎖の５末をラベルしたDNAを用いて解析しました。
その結果は、ゲルシフトで得られている結果（転写因子の結合サイト）を支持する物でした。

そこで質問なのですが、ラベルするのは、どちらの鎖でも構わないのでしょうか？
センス鎖をラベルした結果もとる必要は有るでしょうか？
　
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DNaseI Footprinting 削除/引用
No.1133-1 - 2008/05/15 (木) 11:17:21 - rei
現在、DNaseI Footprintingにて転写因子の結合サイトの同定を試みています。
様々なプロトコルに「DNA片鎖の末端をラベルして解析に用いる」と書いてあります。

今回私は、アンチセンス鎖の５末をラベルしたDNAを用いて解析しました。
その結果は、ゲルシフトで得られている結果（転写因子の結合サイト）を支持する物でした。

そこで質問なのですが、ラベルするのは、どちらの鎖でも構わないのでしょうか？
センス鎖をラベルした結果もとる必要は有るでしょうか？
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