DBTSS(Database of Transcription Start Site)について教えてください。このデータベースに各遺伝子の染色体上における位置情報が記載されていますが、これがNCBIのGENEから得られる情報と異なっています。
例：遺伝子Ａ DBTSSでは115110020〜115125020に、NCBIでは115090020〜115105020に存在する。
少なくとも私が調べた遺伝子に関してはDBTSSでもNCBIでも長さは完全に同じで位置だけがずれているようです。
何故なんでしょうか？マウスの品種によって、ジャンクＤＮＡの長さ、配列が違っていてそのせいで遺伝子をコードする領域の位置がずれているのでしょうか？（遺伝子をコードしている領域は品種が違っても配列はほぼ保存されていると思われます）
DBTSSに問い合わせ先のメールアドレスが記載されているのですが、どうやら別の研究機関に移籍し、アドが無効になっているようです。DBTSSに関する論文に所属する研究所が記載されており、その研究所のラボの教員をかたっぱしから探したのですが同じ名前のひとが見つかりません。 |
|
このスレッドをはてなブックマークに追加