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BCIP/NBTの色が茶色くなります トピック削除
No.4457-TOPIC - 2007/06/25 (月) 10:07:07 - 発色
in situ hybridizationの検出にBCIP/NBTを使っているのですが、シグナルが青くならず、褐色調を呈してしまいます。

Rocheのサイトに、「発色が赤茶色を呈する場合は、NBT/BCIPを添加する前に、pH9.5の検出用バッファーで、ターゲットスライドを十分に濯ぎます。」http://roche-biochem.jp/faq/25_114_ja.html
とあったので、発色前に発色バッファーに10分ほど浸漬してみましたが、改善されませんでした。

シグナル自体はきれいに出ているので評価は可能ですが、本来の色が出ていないことが気になります。

このような経験がありましたら、解決法を教えてください。
よろしくお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.4457-5 - 2007/07/31 (火) 19:05:03 - 発色
Muscleさん、情報ありがとうございます。

> 茶色になるプローブはとても発現量が低いRNAをターゲットにしています。
> しっかり深青色になるプローブは発現量が高いRNAをターゲットにしています。
私も同じ結果です。
さらに発現量が同程度でも、プローブの短いものは茶色に、長いものは青色になります。
組織上のAP酵素(抗体)密度によって、色調が変わるのでしょうか。

もう少し情報がほしいので、新フォーラムにトピック立てます。
ありがとうございました。

茶色のまま論文に 削除/引用
No.4457-4 - 2007/07/31 (火) 17:56:42 - Muscle
私も茶色になっています。
発色前に浸潤させた溶液のpHを測定しても、pH9.5でした。
Rocheのサイトによれば、発現量やプローブの長さによっても変わるようですが、原因は分かりません。
茶色になるプローブはとても発現量が低いRNAをターゲットにしています。
しっかり深青色になるプローブは発現量が高いRNAをターゲットにしています。

論文の中には、茶色のままPublishされているものもあります。


J.Comp.Neurrol. vol.482. pp217-243の論文は茶色です。

(無題) 削除/引用
No.4457-3 - 2007/06/25 (月) 12:00:02 - 発色
>aさん
お返事ありがとうございます。

発色バッファー(100mM Tris, 100mM NaCl, 50mM MgCl2)は用事調製し、pHメーターでpH9.5に合わせています。

おそらく発色液にどこか問題があると思いますが、原因がわからない次第です。

(無題) 削除/引用
No.4457-2 - 2007/06/25 (月) 11:33:08 - a
pHを上げて反応させれば青、pH下がると茶褐色になりますが、
9.5で洗っても青くならないのは?一度も経験したことないですね。

NBT/BCIP溶液のpHは大丈夫でしょうか?確かpH9.5のバッファーに希釈
しますよね

BCIP/NBTの色が茶色くなります 削除/引用
No.4457-1 - 2007/06/25 (月) 10:07:07 - 発色
in situ hybridizationの検出にBCIP/NBTを使っているのですが、シグナルが青くならず、褐色調を呈してしまいます。

Rocheのサイトに、「発色が赤茶色を呈する場合は、NBT/BCIPを添加する前に、pH9.5の検出用バッファーで、ターゲットスライドを十分に濯ぎます。」http://roche-biochem.jp/faq/25_114_ja.html
とあったので、発色前に発色バッファーに10分ほど浸漬してみましたが、改善されませんでした。

シグナル自体はきれいに出ているので評価は可能ですが、本来の色が出ていないことが気になります。

このような経験がありましたら、解決法を教えてください。
よろしくお願いします。

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