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大腸菌からのタンパク抽出
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No.4418-TOPIC - 2007/06/15 (金) 16:33:02 -
itk
大腸菌から破砕機を用いずに界面活性剤などで酵素を抽出したいのですが、なかなかうまくいきません。タンパク抽出用のキットなどもあるみたいですが、かなりの回数の実験を行う予定なので、自前で調製した試薬で行いたいと思っています。今のところTriton-Xを終濃度0.1%で行っているのですが、比活性が非常に弱く、破砕が上手くいっていない状況です。今までに同様の実験をされた経験がある方がいれば、アドバイスをお願いします。
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No.4418-4 - 2007/06/16 (土) 00:58:03 - A
うちラボでは以下のプロトコールで大腸菌からの蛋白抽出やってます。
1.ペレットをPBSで溶く。
2.リゾチームを加えて(最終濃度0.35mg/mL)氷上で1h置く(細胞壁の分解)。
3.液体窒素に入れて凍結、室温の水に入れて溶解を4回繰り返す。
4.DNaseIを加えて(最終濃度3U/mL)氷上で1h置く(DNAの分解)。
5.4度、12,000rmpで30min遠心。
6.上清みをサンプルとして回収。
途中でTritoを加えてリゾチームやDNaseIの酵素反応に影響があるかどうかは
ちょっとわからないですね。
(無題)
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No.4418-3 - 2007/06/15 (金) 18:13:29 - 名無し
比活性が低いということならそれは見たい蛋白質が抽出できていないということだけでなくて抽出過程で蛋白質(酵素ですか?)が失活している可能性も考えないといけないかなあとか思うのでいずれにしてもその蛋白質の性質(局在とか、金属要求性とか、補酵素とか、安定化剤の情報とか、どうすると失活しやすいとか、活性化しやすいとか、そういうのいろいろ)をよく勉強して抽出方法を自分なりに工夫する必要があるのではないでしょうかとちょっと思う。プロテアーゼ阻害剤(あれはプロテアーゼだけに効くとは限らない)とかEDTAとかが邪魔してるかもしれないし。どんな蛋白質か教えてくれたらみんな考えてくれるかもしれない。
(無題)
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No.4418-2 - 2007/06/15 (金) 16:36:21 - B-PER
リゾチームを掛けるのは?
大腸菌からのタンパク抽出
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No.4418-1 - 2007/06/15 (金) 16:33:02 -
itk
大腸菌から破砕機を用いずに界面活性剤などで酵素を抽出したいのですが、なかなかうまくいきません。タンパク抽出用のキットなどもあるみたいですが、かなりの回数の実験を行う予定なので、自前で調製した試薬で行いたいと思っています。今のところTriton-Xを終濃度0.1%で行っているのですが、比活性が非常に弱く、破砕が上手くいっていない状況です。今までに同様の実験をされた経験がある方がいれば、アドバイスをお願いします。
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