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Scion Image トピック削除
No.4295-TOPIC - 2007/05/29 (火) 00:07:59 - わからないことばかり
こんにちは!

つい先日、違うトピで皆さんにお世話になりました。
今、自分の実験結果(ZVI.フォーマット)となる画像を
ScionImageで分析できないかと考えています。

ここで問題となるのがフォーマットです。
ScionImageは通常ZVI.フォーマットを取り入れません。

どなたか、その取り入れを可能にする方法を
ご存知の方いらっしゃるでしょうか
(Pluginとか用いるのでしょうか・・・)?

よろしくお願いします!
 
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(無題) 削除/引用
No.4295-12 - 2007/05/29 (火) 23:27:05 - わからないことばかり
Tさん!

WCIFから、各種プラグインをバンドルして配布されているパッケージ
をインストールしてみました!

ZVIの画像が開けました!
今夜から明日にかけてもう少し試してみたいと思います。
また何かあったらアドバイスよろしくお願いします!

JAVA 削除/引用
No.4295-11 - 2007/05/29 (火) 21:22:52 - わからないことばかり
Tさん。

度々有難うございます!
教えていただいたサイトでやり直そうと思うのですが、
私のパソコンのJREが古いのかもしれません。

これから2時間ほど実験室に行かなければなりませんが、
その後また試してみたいと思います!
また、施行結果をお知らせしたいと思います。

(無題) 削除/引用
No.4295-10 - 2007/05/29 (火) 20:54:38 - T
ヘッダーがないというエラーについては
http://d.hatena.ne.jp/k-kuro/20061124/p1
が参考になるかもしれません。

(無題) 削除/引用
No.4295-9 - 2007/05/29 (火) 20:51:02 - T
こちらで ImageJ Mac OS X 版で試したところ、「注: sun.tools.javac.Main は推奨されません」という警告は出ましたが一応コンパイルされて Plugins メニューに ZVI Reader が追加されました。テスト用の ZVI ファイルがないので、うまく開けるかどうかは未確認ですが。

どうしてもコンパイルがうまく行かないようなら、Bio-Formats の方を試してはどうでしょうか。これなら plugins フォルダに入れるだけでコンパイルは必要ありません。
http://www.loci.wisc.edu/ome/formats.html

また、各種プラグインをバンドルして配布されているパッケージもあるようです。このパッケージをインストールすれば、下のサイトのマニュアル通りの操作が可能になるはずです。
http://www.uhnresearch.ca/facilities/wcif/imagej/installing_imagej.htm

エラー内容 削除/引用
No.4295-8 - 2007/05/29 (火) 20:45:02 - わからないことばかり
Tさん。

ImageJ上のPluginでZVI-Readerの名前は出るのですが、
そこをクリックしてZVIフォーマットを開こうとすると
Could not find Header Information

というエラーが出ます。
どうしたらいいんでしょうか。。。
アドバイス頂けたら嬉しいです。

classが。。。 削除/引用
No.4295-7 - 2007/05/29 (火) 20:37:43 - わからないことばかり
Tさん。

早速のお返事ありがとうございます!
ZVI-Reader.javaをImageJのPluginフォルダーに
ダウンロードしたところまではいいのですが、
コンパイルする段階でclassファイルが出てきません。
エラーとして、Blockと名前のついたフォルダーが出てきます。

どうしたらいいか今ネットで情報を探しているのですが。。。

よろしくお願いします!

(無題) 削除/引用
No.4295-6 - 2007/05/29 (火) 20:10:38 - T
どううまく行かないのでしょうか?
インストールはうまく行ったのですか?

ありがとうございます! 削除/引用
No.4295-5 - 2007/05/29 (火) 20:07:02 - わからないことばかり
Tさん。アドバイスありがとうございます!
ImageJのPlugin(ZVI−Reader)を試してみたのですが、
今のところうまく行きません。

Pluginの仕方について細かいマニュアルとかご存知でしょうか?
よろしくお願いします。。。

(無題) 削除/引用
No.4295-4 - 2007/05/29 (火) 17:36:07 - T
Scion Image ではないですが、ImageJ なら ZVI ファイルを読み込むプラグインがあります。
http://imagejdocu.tudor.lu/imagej-documentation-wiki/faq?full=1

ありがとうございます! 削除/引用
No.4295-3 - 2007/05/29 (火) 16:19:05 - わからないことばかり
おおさん。

お返事ありがとうございます。
確かに、Zeiss社のソフトなのですが、
やはり、ScionImageがフリーウェアなだけに、
直接問い合わせるのは無粋ではないかと思ったのです・・・。

問い合わせてみたいと思います。
また、何かご存知でしたらよろしくお願いします!

(無題) 削除/引用
No.4295-2 - 2007/05/29 (火) 03:21:43 - おお
ZVIってZeissのソフトのフォーマットだったと思うですが、Zeissのソフトで開いて、TIFFに変換して保存するといいのでは?プラグインとかも必要と思うのならZeissの人に聞くのが早いと思いますが、、、

Scion Image 削除/引用
No.4295-1 - 2007/05/29 (火) 00:07:59 - わからないことばかり
こんにちは!

つい先日、違うトピで皆さんにお世話になりました。
今、自分の実験結果(ZVI.フォーマット)となる画像を
ScionImageで分析できないかと考えています。

ここで問題となるのがフォーマットです。
ScionImageは通常ZVI.フォーマットを取り入れません。

どなたか、その取り入れを可能にする方法を
ご存知の方いらっしゃるでしょうか
(Pluginとか用いるのでしょうか・・・)?

よろしくお願いします!

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