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Scion Image
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No.4295-TOPIC - 2007/05/29 (火) 00:07:59 -
わからないことばかり
こんにちは!
つい先日、違うトピで皆さんにお世話になりました。
今、自分の実験結果(ZVI.フォーマット)となる画像を
ScionImageで分析できないかと考えています。
ここで問題となるのがフォーマットです。
ScionImageは通常ZVI.フォーマットを取り入れません。
どなたか、その取り入れを可能にする方法を
ご存知の方いらっしゃるでしょうか
(Pluginとか用いるのでしょうか・・・)?
よろしくお願いします!
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(無題)
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No.4295-12 - 2007/05/29 (火) 23:27:05 -
わからないことばかり
Tさん!
WCIFから、各種プラグインをバンドルして配布されているパッケージ
をインストールしてみました!
ZVIの画像が開けました!
今夜から明日にかけてもう少し試してみたいと思います。
また何かあったらアドバイスよろしくお願いします!
JAVA
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No.4295-11 - 2007/05/29 (火) 21:22:52 -
わからないことばかり
Tさん。
度々有難うございます!
教えていただいたサイトでやり直そうと思うのですが、
私のパソコンのJREが古いのかもしれません。
これから2時間ほど実験室に行かなければなりませんが、
その後また試してみたいと思います!
また、施行結果をお知らせしたいと思います。
(無題)
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No.4295-10 - 2007/05/29 (火) 20:54:38 - T
ヘッダーがないというエラーについては
http://d.hatena.ne.jp/k-kuro/20061124/p1
が参考になるかもしれません。
(無題)
削除/引用
No.4295-9 - 2007/05/29 (火) 20:51:02 - T
こちらで ImageJ Mac OS X 版で試したところ、「注: sun.tools.javac.Main は推奨されません」という警告は出ましたが一応コンパイルされて Plugins メニューに ZVI Reader が追加されました。テスト用の ZVI ファイルがないので、うまく開けるかどうかは未確認ですが。
どうしてもコンパイルがうまく行かないようなら、Bio-Formats の方を試してはどうでしょうか。これなら plugins フォルダに入れるだけでコンパイルは必要ありません。
http://www.loci.wisc.edu/ome/formats.html
また、各種プラグインをバンドルして配布されているパッケージもあるようです。このパッケージをインストールすれば、下のサイトのマニュアル通りの操作が可能になるはずです。
http://www.uhnresearch.ca/facilities/wcif/imagej/installing_imagej.htm
エラー内容
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No.4295-8 - 2007/05/29 (火) 20:45:02 -
わからないことばかり
Tさん。
ImageJ上のPluginでZVI-Readerの名前は出るのですが、
そこをクリックしてZVIフォーマットを開こうとすると
Could not find Header Information
というエラーが出ます。
どうしたらいいんでしょうか。。。
アドバイス頂けたら嬉しいです。
classが。。。
削除/引用
No.4295-7 - 2007/05/29 (火) 20:37:43 -
わからないことばかり
Tさん。
早速のお返事ありがとうございます!
ZVI-Reader.javaをImageJのPluginフォルダーに
ダウンロードしたところまではいいのですが、
コンパイルする段階でclassファイルが出てきません。
エラーとして、Blockと名前のついたフォルダーが出てきます。
どうしたらいいか今ネットで情報を探しているのですが。。。
よろしくお願いします!
(無題)
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No.4295-6 - 2007/05/29 (火) 20:10:38 - T
どううまく行かないのでしょうか?
インストールはうまく行ったのですか?
ありがとうございます!
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No.4295-5 - 2007/05/29 (火) 20:07:02 -
わからないことばかり
Tさん。アドバイスありがとうございます!
ImageJのPlugin(ZVI−Reader)を試してみたのですが、
今のところうまく行きません。
Pluginの仕方について細かいマニュアルとかご存知でしょうか?
よろしくお願いします。。。
(無題)
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No.4295-4 - 2007/05/29 (火) 17:36:07 - T
Scion Image ではないですが、ImageJ なら ZVI ファイルを読み込むプラグインがあります。
http://imagejdocu.tudor.lu/imagej-documentation-wiki/faq?full=1
ありがとうございます!
削除/引用
No.4295-3 - 2007/05/29 (火) 16:19:05 -
わからないことばかり
おおさん。
お返事ありがとうございます。
確かに、Zeiss社のソフトなのですが、
やはり、ScionImageがフリーウェアなだけに、
直接問い合わせるのは無粋ではないかと思ったのです・・・。
問い合わせてみたいと思います。
また、何かご存知でしたらよろしくお願いします!
(無題)
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No.4295-2 - 2007/05/29 (火) 03:21:43 -
おお
ZVIってZeissのソフトのフォーマットだったと思うですが、Zeissのソフトで開いて、TIFFに変換して保存するといいのでは?プラグインとかも必要と思うのならZeissの人に聞くのが早いと思いますが、、、
Scion Image
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No.4295-1 - 2007/05/29 (火) 00:07:59 -
わからないことばかり
こんにちは!
つい先日、違うトピで皆さんにお世話になりました。
今、自分の実験結果(ZVI.フォーマット)となる画像を
ScionImageで分析できないかと考えています。
ここで問題となるのがフォーマットです。
ScionImageは通常ZVI.フォーマットを取り入れません。
どなたか、その取り入れを可能にする方法を
ご存知の方いらっしゃるでしょうか
(Pluginとか用いるのでしょうか・・・)?
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