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ラーゲーション後のコロニーがでない トピック削除
No.4260-TOPIC - 2007/05/23 (水) 13:30:04 - ゆうさん
はじめまして。

pcDNA3にクローニングされている遺伝子を、HindVとEcoRXで切断し、
レトロウイルスベクターが持つ、HpaTとHindVのサイトに組み込もうと
実験をしています。

しかし、ラーゲーション後プレートにスプレットしてもコロニーが
全くでません。バックさえもありません。
理由がわからず困っています。

方法としては

目的遺伝子が乗っているpcDNA3をHindVとEcoRXで切断し
アガロースで分離し目的遺伝子を切り出します。

クローニングするベクターをHpaTとHindVでそれぞれ別々に反応させ
(Bufferが違うので)切断後アガロースで分離しベクターの切り出し
を行いました。

その後、それぞれをアガロースで泳動し濃度をチェックした後に、
1:5の割合で室温2時間でライゲーションを行いました。

トランスフォーム後LBプレートにスプレットし、37℃で培養をしています。

詳しい方がいらっしゃいましたら、お教えいただけますでしょうか。
 
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(無題) 削除/引用
No.4260-3 - 2007/05/23 (水) 16:30:29 - 〜
チェック項目としては、
1.DNAフラグメントは適切か、
2.ライゲーションは適切か、
3.トランスフォーメーションは適切か、
4.トランスフォーメーション後の培養は適切か、
があると思います。

どこまでコントロールを置いて確認していますか?

(無題) 削除/引用
No.4260-2 - 2007/05/23 (水) 14:06:32 - 歴史家
過去に繰り返されたトピックです。例えば↓。
http://www.kenkyuu.net/cgi-biotech/biotechforum.cgi?mode=view;start=8;Code=2231

ラーゲーション後のコロニーがでない 削除/引用
No.4260-1 - 2007/05/23 (水) 13:30:04 - ゆうさん
はじめまして。

pcDNA3にクローニングされている遺伝子を、HindVとEcoRXで切断し、
レトロウイルスベクターが持つ、HpaTとHindVのサイトに組み込もうと
実験をしています。

しかし、ラーゲーション後プレートにスプレットしてもコロニーが
全くでません。バックさえもありません。
理由がわからず困っています。

方法としては

目的遺伝子が乗っているpcDNA3をHindVとEcoRXで切断し
アガロースで分離し目的遺伝子を切り出します。

クローニングするベクターをHpaTとHindVでそれぞれ別々に反応させ
(Bufferが違うので)切断後アガロースで分離しベクターの切り出し
を行いました。

その後、それぞれをアガロースで泳動し濃度をチェックした後に、
1:5の割合で室温2時間でライゲーションを行いました。

トランスフォーム後LBプレートにスプレットし、37℃で培養をしています。

詳しい方がいらっしゃいましたら、お教えいただけますでしょうか。

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