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TNF-αのASK-1活性化実験について トピック削除
No.4174-TOPIC - 2007/05/08 (火) 17:37:51 - you
TNF-αのASK-1活性化の実験において、MnSODやUCP1によるASK-1活性の抑制の結果についてなんですが、mock(ASK1活性化レベル100)にTNF-αを作用させると活性化レベルが160まで上がりました。MnSODやUCP1を過剰発現させたものにTNF-α処置をしたところ活性化レベルが80ほどまで抑制されていました。ここまでは理解できるのですが、MnSODやUCP過剰発現タイプのTNF-α未処置のものが活性化レベル100ほどありました。TNF-αを加えているものの方が活性化レベルが低いという意味がわかりません...どういったことでこのような結果になるのか調べてみてもわかりません。どなたかアドバイスをお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.4174-3 - 2007/05/09 (水) 01:20:27 - 門外漢
私は一切の門外漢ですので勘違いがあるかもしれません。そこを差し引いて読んでください。
TNF で ASK1 を活性化する系で、その阻害剤であるMnSODやUCP1でその活性を押さえる実験をしたいんですよね?
まず、mock での活性化レベルが100とありますので、コントロールを100%としたときの値が100%と言う事(つまり変化なし)ということだと思います。
すると、MnSODやUCP1単独で処理し、TNF を加えていないときの活性化レベルが100というのは最も理想的な事だと思います。つまり実験に使う阻害剤そのものは ASK の活性に影響を与えないと言う事ですので。ASK の活性に影響を与えない阻害剤で TNF による刺激を抑制すると活性が80に下がるということは、ASK に無関係な経路を介してASK に対するネガティブフィードバックがかかっているという事では無いでしょうか?TNF を単独で作用させたときの値が160とあります。これは180の活性化と20のネガティブフィードバックの結果、見かけ上の数値として160が出てくるという解釈が可能だと思います(かなり単純化した解釈ですのでその辺はご注意ください)。MnSODやUCP1がどういったメカニズムで阻害してるのかわからないのでASKが「関与する」ネガティブフィードバックかもしれません。

いずれにしても、です。出題文が良く練られていないので何を書かれているのか分からない部分があります。「活性化レベルが100」とか、そういった部分です。勝手に想像するに、若い大学院生の方ではないでしょうか?質問の内容が分からない場合は大抵やっている実験の意味や内容が良くできていない事が多いので、こういうところで一人でこそっと質問するよりも周りの院生や先生にデータをもっていって日頃からディスカッションを積んだ方が良いと思います。老婆心ご容赦。

(無題) 削除/引用
No.4174-2 - 2007/05/08 (火) 23:34:42 - ask
この場には、あまりに(=too)specificなご質問なので、関連論文の筆頭著者、もしくはASK-1の発見者である東大の一條先生にでも問い合わせてみればいかがですか?

TNF-αのASK-1活性化実験について 削除/引用
No.4174-1 - 2007/05/08 (火) 17:37:51 - you
TNF-αのASK-1活性化の実験において、MnSODやUCP1によるASK-1活性の抑制の結果についてなんですが、mock(ASK1活性化レベル100)にTNF-αを作用させると活性化レベルが160まで上がりました。MnSODやUCP1を過剰発現させたものにTNF-α処置をしたところ活性化レベルが80ほどまで抑制されていました。ここまでは理解できるのですが、MnSODやUCP過剰発現タイプのTNF-α未処置のものが活性化レベル100ほどありました。TNF-αを加えているものの方が活性化レベルが低いという意味がわかりません...どういったことでこのような結果になるのか調べてみてもわかりません。どなたかアドバイスをお願いします。

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