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インテルマックでClassic環境の制限酵素マップDNA配列解析ソフト トピック削除
No.4120-TOPIC - 2007/04/27 (金) 12:52:28 - minmin
新しいインテルマックだとついにClassic環境のソフトは使えなくなるのですね。以前はDNAsisという日立のソフトを使っていたのですがOSX対応の簡単で便利なソフト(できれば無料)は何がお勧めですか?初歩的な質問で失礼いたします。ORFや制限酵素サーチできるだけ使い勝手のよい制限酵素マップをかけるものなどがあると助かります。

またそれ以前にインテルマックでClassic環境のOSを走らせるエミュレータがあるそうですが、MacOS7.5位の古いソフトでも問題なく動かせる方法をご存知の方お教えください。

よろしくお願いいたします。
 
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インテルマックでClassic環境の制限酵素マップDNA配列解析ソフト 削除/引用
No.4120-9 - 2007/05/08 (火) 02:01:27 - minmin
ボブさん、Tさん

詳しい説明どうもありがとうございました。
まだSheepShaverがworkしていないので、なんとも
言えませんが、MapDrawII試してみます。ApE試して
みました。DNAsisのファイルも読め、かつABIのSequence
の生ファイルも読めたので安心しました。マップはMapDrawII
ほどではないですがより操作が簡単なことを考えれば、
問題なく使える範囲内で、ApEがあればIntel Macに移行しても
Macでいけそうです。ほっとしました。

MapDrawII 削除/引用
No.4120-8 - 2007/05/06 (日) 23:08:30 - T
Desktop Printer Utility を使えば IP プリンタに出力する事が可能です。
というか、SheepShaver では普通の AppleTalk は使えないので、通常のプリントも全て IP を介した出力になります。

しかし確かに USB プリンタには出力できませんし、そもそも一々プリントするのは後で加工もできなくて何かと不便なので、実際はほとんど PDF ファイルにしています。

PDF writer とか AdobePS といったプリンタドライバを指定すれば直接 PDF ファイルとして出力が可能ですし、そういったソフトを持っていなくても、PostScript モードで出力される PS データを保存すれば、Acrobat Distiller や OS X 付属の Preview を使って PDF ファイルに変換できます。

(無題) 削除/引用
No.4120-7 - 2007/05/06 (日) 22:05:03 - ボブ
ApEでいいじゃん
きれ〜だしfreeだし
macのデフォじゃない?

インテルマックでClassic環境の制限酵素マップDNA配列解析ソフト 削除/引用
No.4120-6 - 2007/04/28 (土) 15:25:26 - minmin
Tさん、

ご返答どうもありがとうございました。私も以前 MapDrawIIを入手して使っていましたが、私の持っていたバージョンだと出力の際にClassic環境のセレクタからレーザープリンタを選んでおかないと印刷できないという問題があり、最近はプリンタをIPアドレス設定して印刷するのが主流になったのと、USB接続してあるプリンタでは印刷できないという状況からほぼ使えなくなっていました。Tさんは現在でも使っておられるということで印刷の設定の問題点をどうやって克服しておられるのか簡単に教えてもらえると助かります。またIntel MacでもSheepShaverを介して使っておられるのですか?

(無題) 削除/引用
No.4120-5 - 2007/04/28 (土) 08:59:35 - T
OS X 用ではないですが、MapDrawII というフリーウェアを使っています。
機能は単純ですが、出力の美しさは高価な市販ソフトを遙かに上回ります。

問題は、今となっては非常に入手困難という点でしょうか。
私は大昔(多分 System 6 などの時代)に Nifty-Serve で入手した記憶がありますが、現時点ではオンライン上には見当たらないようです。

OS X 対応でフリーウェアでとなると、別トピックで名前の挙がっていた ApE などが候補になるかと思います。

制限酵素マップ 削除/引用
No.4120-4 - 2007/04/28 (土) 07:02:43 - minmin
過去のフォーラムを読み参考にさせて頂きました。ありがとうございました。さらに質問ですが、プラスミドなどの詳しい制限酵素マップを書くよいOSX対応のソフトはご存知ですか?

(無題) 削除/引用
No.4120-3 - 2007/04/27 (金) 18:36:33 - T
SheepShaver というエミュレータを使って MacBookPro Core2Duo 上で Mac OS 9.0.4 を動かし、DNASIS 3.2 を日常的に使っています。OS X native のソフトも色々試しましたが、結局 DNASIS が一番しっくり来るので、未だに手放せません。

SheepShaver では DNASIS とたまに StatView を使うくらいですが、その限りでは非常に安定しています。

下記のトピックも参考にしてください。

http://www.kenkyuu.net/cgi-comp/compforum.cgi?mode=view;Code=226

(無題) 削除/引用
No.4120-2 - 2007/04/27 (金) 16:35:33 - 奴隷
関連するトピックがついこの間ありました。
http://www.kenkyuu.net/cgi-biotech/biotechforum.cgi?mode=view;Code=4084

インテルマックでClassic環境の制限酵素マップDNA配列解析ソフト 削除/引用
No.4120-1 - 2007/04/27 (金) 12:52:28 - minmin
新しいインテルマックだとついにClassic環境のソフトは使えなくなるのですね。以前はDNAsisという日立のソフトを使っていたのですがOSX対応の簡単で便利なソフト(できれば無料)は何がお勧めですか?初歩的な質問で失礼いたします。ORFや制限酵素サーチできるだけ使い勝手のよい制限酵素マップをかけるものなどがあると助かります。

またそれ以前にインテルマックでClassic環境のOSを走らせるエミュレータがあるそうですが、MacOS7.5位の古いソフトでも問題なく動かせる方法をご存知の方お教えください。

よろしくお願いいたします。

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